我国胜利绘制天下首个野生梨基因组图谱
发表于:2019-08-12 15:00

  中国青年报客户端北京8月7日电(中国青年报·中国青年网记者 邱晨辉)记者明天从中国农业迷信院得悉,该院果树研讨所研讨员曹玉芬团队与中国迷信院遗传与发育生物学研讨所研讨员田志喜团队已于日前配合组装了高品质的杜梨参考基因组序列,这是天下首个野生梨的基因组图谱,也是我国在梨基因组学研讨范畴又一严重研讨停顿。

  相干研讨结果已于克日在线宣布于国际学术期刊《动物生物技巧》。

  

  据曹玉芬团队先容,科研职员以山西杜梨为资料,联合PacBio三代测序、Bionano光学图谱、Hi-C技巧,组装了高品质的杜梨参考基因组序列。详细来看,杜梨基因组组装巨细为532.7兆,contig N50为1.57兆,共有59552个卵白质编码基因跟247.4兆反复序列被解释,经由过程BUSCO对基因组完全性停止评价,完全性到达95.9%。

  论文第一作者、中国农科院果树研讨所博士董星光称,杜梨扩大基因在次生代谢通路中明显富集,可能进而影响杜梨较强的顺境顺应性。对剖析成果表现,驯化进程中,西方梨的果实巨细、糖代谢跟转运,以及光合效力遭到正向抉择。

  研讨同时发明,梨属动物在驯化进程中果实酸涩味逐步消散。杜梨原花青素分解构造基因拷贝数明显多于白梨,影响了原花青素的积聚,同时花青素复原酶代谢道路是原花青素分解的独一道路,山梨醇转运卵白跨膜转运可能是影响可溶性无机物资积聚的重要要素。

  研讨团队以为,该基因组的颁布丰盛了梨属动物基因组信息,同时将为梨基因组研讨、功效基因发掘、梨属动物驯化以及野生资本应用供给主要保证。

  (教导迷信部编纂)

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